1952年6月19日，随着医院的建立，“北京苏联红十字医院图书室”也正式成立，并逐步开展文献收集、整理和借阅工作。1953年底，北京苏联红十字医院图书室升级为北京苏联红十字医院图书馆。

　　图书馆最早订购的中文期刊有商务印书馆出版的《大众医学》，人民军医社华东分社出版的《内科学报》(中华内科杂志的前身)和《外科学报》(中华外科杂志的前身)。目前可以查询到的中文期刊最早借阅记录为《内科学报》第7期，读者于1952年7月23日借出，应归还日期为1952年8月4日，由此可以推断图书室成立之初即开始了图书、期刊的借阅工作。

　　建馆初期，图书馆除了订购图书和期刊之外，还接收其他医院图书馆、编辑部捐赠交换过来的书刊。本馆最早的交换期刊为《山西医学杂志》1957年的创刊号，此外还有北京大学人民医院图书馆(当时为中央人民医院图书馆)赠送的《生物学通报》1956年4期;北京医院图书馆赠送的《The Journal of Pediatrics》1951年38卷1期。

　　为了满足当时苏联专家的需要，图书馆还购买了许多俄文图书、期刊和工具书，因此俄文文献也是北京友谊医院图书馆的特色馆藏。当年图书馆设立在医院科研二号楼中。直到2012年，图书馆搬迁至教学楼，这些俄文期刊也随之迁移并得以保存至今。

　　1999年，图书馆开始了自动化建设，以往从现刊登到、期刊装订上架、新书入库要经历很多个手工环节，写很多张卡片，还要登记财产账。每年期刊装订入库，馆里的6名同志流水作业，需要两个多月的时间才能完成。图书馆实现自动化管理以后，期刊装订入库的时间缩短了一半，工作人员的采编工作也减少了很多。

　　上世纪九十年代初，图书馆购买了MEDLINE光盘数据库和CBMDISC光盘数据库，图书馆的专业人员可以用它们为读者进行文献检索，虽然操作时需要一张张更换光盘，很不方便，但在当时，这已经是很先进的服务了。运用这个设备，读者不需要一本本翻阅厚厚的检索工具，也不需要拿小本子摘录需要的一条条文献信息。光盘数据库不仅提高了检索效率，也提高了检索的准确性。

　　上世纪九十年代末，图书馆陆续又购买了清华同方的中文期刊全文库，团购了SPRINGER电子期刊库，并建立了图书馆局域网和图书馆网站。读者可以自行到图书馆检索、使用这些数字资源。虽然当时的全文电子期刊和图书的数据库数量比较少，还不能够完全满足读者的需要，但是相比较之前的文摘性数据库，图书馆的服务又前进了一步。

　　2005年，首都医科大学图书馆与6家附属医院图书馆实现了电子资源的共建共享，可利用的数字资源越来越丰富。2019年首都医科大学图书馆在数据库建设方面投入的资金达到1200万元，购买中外文数据库60余种，外文全文电子期刊达到1万种。中外文电子期刊、图书、学位论文、循证医学库、多媒体资源等应有尽有，为首都医科大学科研、临床和教学工作提供了强有力的文献支撑。

　　随着近些年数据库技术和互联网技术的发展，医院图书馆也得到了快速发展，由原来以纸本馆藏为主的传统图书馆，逐渐发展成为了以电子馆藏为主的数字化图书馆。无论从采编、流通等日常工作，还是从馆藏结构、服务方式、服务内容等方面都发生了翻天覆地的变化。医院图书馆相继开展了查新查引查重、文献传递、数据库使用培训等新型服务。

　　技术的发展和进步使得图书馆的馆藏越来越丰富，服务手段越来越多样、服务范围也得以延伸，可以全方位、全天候为读者科研工作提供文献支持。读者在科室、在家中、甚至在国内、外进修学习，参加学术会议，都可以通过互联网访问和利用图书馆购买的电子资源。医院图书馆的数字化为科研人员检索和利用文献提供了便利，为科研插上了腾飞的翅膀。